L'église de Sant Francesc est située dans l'imposante Rua Montcada, c'est une église de style gothique cistercien qui a été construite dans la seconde moitié du XIVe siècle, elle avait une seule nef avec sept chapelles latérales. L'église a une seule nef avec des arcs brisés et un toit en bois poli. Il possède également sept chapelles latérales nervurées entre les contreforts intérieurs, où s'ouvraient des fenêtres à plateau gothique. A l'intérieur, il y a le retable de la Verge de la Llet (Vierge du lait) de Valentí Montoliu, qui appartient à l'école Morellano-Aragonese. C'est le seul vestige architectural du couvent disparu de Sant Francesc, fondé par Jaume I.

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Il donna son nom à l'une des portes du mur à côté duquel il se trouvait.

L'une des fenêtres avec des traces gothiques qui est intégrée dans les murs de l'église, qui a été rénovée au XVIIIe siècle.

En raison de sa proximité avec les palais de la noblesse de Séville, il est devenu le panthéon des familles les plus illustres de Xàtiva. De nombreux personnages y ont été enterrés : le comte d'Urgel, prétendant à la couronne d'Aragon dans le compromis de Caspe, et de nombreux membres de familles importantes de la Costera.  

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À la fin du XIVe siècle, la Borja possédait la chapelle funéraire dans cette église. Là ont été enterrés Catherine de Borja, sœur de Callisto III, les grands-parents de Roderic de Borja (Pape Alexandre VI) et d'autres parents. En 1470, les restes ont été transférés à l'Ordre.

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L'ensemble a été touché par un incendie au XVIIIe siècle, et a été restauré et couvert selon les goûts de l'époque. 

En 1976, son « enveloppe » baroque a été retirée, laissant la structure gothique d'origine.